Embedding-Ähnlichkeit1 − Kosinus-Distanz / 2 — immer verfügbar.
Identität NWNeedleman-Wunsch globale Sequenzidentität [0, 1].
Identität SWSmith-Waterman lokale Sequenzidentität [0, 1].
EvidenzgewichtQualität des GO-Evidenzcodes der Referenzannotation.
Taxonomische Nähe1 / (1 + taxonomische_Distanz)
linear: Σ(w_i · s_i) / Σ(w_i) over all active (w_i > 0 and signal available) signals.
evidence_weighted: Same as linear, then multiplied by the resolved evidence weight — down-ranks IEA even when other signals are strong.
PROTEA