Protein Functional Embedding-based Annotation

PROTEA

Von der Sequenz zur funktionellen Annotation durch Embedding-Ähnlichkeit und gelerntes Re-Ranking

Ihre Proteine annotieren

Proteinsequenzen im FASTA-Format einfuegen und automatisch funktionelle Annotationen mit der besten verfuegbaren Methode erhalten.

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Bestes Gesamtergebnis

Top FmaxFmax: the maximum F1 score across all decision thresholds. The standard CAFA metric for ranking GO-term predictions. across the NKNo Knowledge: the test protein has no experimental GO annotations of any aspect at the train cutoff. Strictest CAFA split. / LKLimited Knowledge: the protein is annotated in other aspects but not the one under evaluation. / PKPartial Knowledge: the protein is already annotated for the same aspect, so scoring only counts newly added terms. CAFA splits