Similaridade de embedding1 − distância cosseno / 2 — sempre disponível.
Identidade NWIdentidade de sequência global Needleman-Wunsch [0, 1].
Identidade SWIdentidade de sequência local Smith-Waterman [0, 1].
Peso de evidênciaQualidade do código de evidência GO da anotação de referência.
Proximidade taxonômica1 / (1 + distância_taxonômica)
linear: Σ(w_i · s_i) / Σ(w_i) over all active (w_i > 0 and signal available) signals.
evidence_weighted: Same as linear, then multiplied by the resolved evidence weight — down-ranks IEA even when other signals are strong.
PROTEA