Similitud de embedding1 − cosine_distance / 2 — siempre disponible.
Identidad NWIdentidad de secuencia global Needleman-Wunsch [0, 1].
Identidad SWIdentidad de secuencia local Smith-Waterman [0, 1].
Peso de evidenciaCalidad del código de evidencia GO de la anotación de referencia.
Proximidad taxonómica1 / (1 + distancia_taxonómica)
linear: Σ(w_i · s_i) / Σ(w_i) over all active (w_i > 0 and signal available) signals.
evidence_weighted: Same as linear, then multiplied by the resolved evidence weight — down-ranks IEA even when other signals are strong.
PROTEA