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PROTEAAnotación funcional de proteínas basada en embeddings

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Los comentarios y métricas son públicos y visibles para todos los visitantes.

Protein Functional Embedding-based Annotation

PROTEA

De secuencia a anotación funcional mediante similitud de embeddings y re-ranking aprendido

Anota tus proteinas

Pega tus secuencias de proteinas en formato FASTA y obtiene anotaciones funcionales automaticamente con el mejor metodo disponible.

Entrada de secuencia en formato FASTA

Explorar Resultados→Anotar Mis Proteinas

Aun no hay datos de evaluacion. Ejecuta el pipeline para ver resultados aqui.

Pipeline

From sequence input to functional annotation

AaSecuencias528.513Proteinas indexadas desde UniProt con FASTA deduplicadover→

EEmbeddings0Un vector por proteina calculado por 8 PLMsver→

KBusqueda KNN0k vecinos mas cercanos transfieren sus terminos GOver→

RRe-ranker0LightGBM reordena candidatos con caracteristicas aprendidasver→

FEvaluacion0Fmax / AuPRC al estilo CAFA por aspectover→

Estadisticas de la Plataforma

Live counts across the data layer

617.103

Proteinas

528.513

Secuencias

0

Embeddings

0

Predicciones